टोमॅटो ब्राउन रगोज फ्रूट व्हायरस टोमॅटो आणि मिरपूडच्या झाडांना जगभरात संक्रमित करत असल्याने, बियाणे कंपन्या प्रतिरोधक टोमॅटोच्या प्रजननावर काम करत आहेत.
टोमॅटोचे जीनोमिक सिक्वेन्सिंग प्रकल्प सुरू होण्यापूर्वीच टोमॅटो उत्पादकांना समृद्ध अनुवांशिक आणि जीनोमिक संसाधने उपलब्ध होती. टोमॅटो जर्मप्लाझमचे मोठे संग्रह अनेक ठिकाणी स्थापित केले गेले आहेत. जगभरातील जीनबँकमध्ये 75,000 हून अधिक टोमॅटो ऍक्सेसन्स संरक्षित आहेत. सर्वात मोठ्यांपैकी एक म्हणजे जिनेव्हा, NY येथे USDA genebank.
टोमॅटो जीनोमचा क्रम 2005 मध्ये 14 देशांमधील बहुराष्ट्रीय प्रयत्न म्हणून सुरू करण्यात आला आणि 2012 मध्ये पूर्ण झाला. मोठ्या प्रमाणात अनुवांशिक आणि phenotypic डेटाचे विश्लेषण करण्यासाठी कृत्रिम बुद्धिमत्ता, मशीन लर्निंग आणि प्रगत अल्गोरिदम वापरून या प्रयत्नांना मोठ्या प्रमाणात गती मिळाली आहे.
टोमॅटो पॅन-जीनोम
2020 मध्ये बॉयस थॉम्पसन संस्थेच्या संशोधकांनी टोमॅटोचा अधिक परिपूर्ण आणि उपयुक्त पॅन-जीनोम तयार करण्यासाठी वन्य टोमॅटोसाठी उच्च-गुणवत्तेचा संदर्भ जीनोम तयार केला. त्यांनी जीनोमचे असे विभाग शोधून काढले ज्यात फळांची चव, आकार आणि पिकणे, ताण सहन करण्याची क्षमता आणि रोग प्रतिकारशक्ती यांचा समावेश होतो. डीएनएचे खूप लांब तुकडे वाचू शकणार्या अत्याधुनिक सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञानामुळे, संदर्भ जीनोम सध्याच्या डेटाबेसपेक्षा अधिक परिपूर्ण आणि अचूक आहे.
डीएनएचे छोटे तुकडे वाचणारे जुने सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान सिंगल-बेस स्तरावर उत्परिवर्तन ओळखतात. तथापि, डीएनएच्या मोठ्या भागांची अंतर्भूत करणे, हटवणे, उलटणे किंवा डुप्लिकेशन यासारखे संरचनात्मक रूपे शोधण्यात ते चांगले नाहीत.
2019 मध्ये, संशोधकांच्या एका आंतरराष्ट्रीय गटाने 725 फायलोजेनेटिक आणि भौगोलिकदृष्ट्या प्रतिनिधी जातींमधून जीनोम अनुक्रम वापरून टोमॅटो पॅन-जीनोम तयार केला. या डेटाबेसमध्ये मूळ संदर्भ जीनोममध्ये न सापडलेल्या 4,873 जीन्सचा समावेश आहे. सध्याच्या/गैरहजर फरकाच्या विश्लेषणातून टोमॅटोचे पालन आणि सुधारणेदरम्यान जीन्स आणि प्रवर्तकांची लक्षणीय जीन्स हानी आणि तीव्र नकारात्मक निवड दिसून आली.
www.seedworld.com वर संपूर्ण लेख वाचा.